顺应潮流：仅血浆ctDNA-MRD检测的应用现状！

"底物被划入MRD探测的前瞻性是明确的，努力这些方面将再次更加更高这一代MRD探测的特质能。"

帕金森氏症的MRD探测是一种能用且特异的可用受控帕金森氏症病人血浆当中源特质遗传物质（如ctDNA）相较数目的工具。在这种精神状态下，病人没有太阳光可见的病变，但确有存在标准化皆科影像工具无法探测到但再一但会导致帕金森氏症罹患的或多或少病变。

MRD，常统称或多或少存留病变（Minimal Residual Disease）。采用“Minimal” （或多或少）这个词，是因为它在史籍和皆科医学专家当中更加常用。不过，“Minimal”这个词意味著兼具“误导特质”，因为低更高水平的病变在病状和疗程决策方面也意味著兼具最重要意味。“Measurable”（可精确测量）一词可更加确切地刻画存留在病人体内的骨髓的存在。NCCN须知同时采用了“Minimal Residual Disease”（或多或少存留病变）和“Measurable Residual Disease”（可精确测量存留病变）两个术语。

此皆，可行特质分析表明在分子合构更高水平上探测多种帕金森氏症类别的ctDNA或多或少兼具皆科效用，史籍和皆科医学专家有时也但会采用“Molecular Residual Disease”（分子合构存留病变）一词。

近年来，国内皆在本体当中基于ctDNA的MRD分析报告（ctDNA-MRD）的皆科合果显示和证词越来越多，开启了本体瘤MRD探测的热潮。本体瘤ctDNA-MRD探测的高效率流派主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（可疑分析工具）

对原发许多三组织开展高通量以鉴定病人的特异遗传物质变异图谱，然后设计者多肽个性化panel或采用通常panel开展个特质本土化的ctDNA探测分析工具。

2）Tumor-uninformed assays（不可疑分析工具）

也可以统称Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即必需要原发许多三组织，相当少依赖于一三组可先敲定多肽/探针设计者的与帕金森氏症类别无关的通常panel开展ctDNA探测分析工具，常在探测ctDNADNA型的同时，都以ctDNA底物或图片三组学等多三组学工具。太少了许多三组织合果显示过剩或受控位点过剩或TAT过长等难题。

Tumor-informed assays的高效率策略更加合理大众的认知，在保障更高抗原的同一时间提下，可通过受控多位点的sample-level（合果显示更高水平）进一步更加更高其能用度，高效率上限相较来说不是例皆更高。Tumor-uninformed assays的高效率策略更加类似于早滴，通过更加更高site-level（位点更高水平）探测能用度并都以ctDNA底物或图片三组学并融合机器学习算法进一步更加更高其能用度和抗原，高效率上限相较来说较更高。

2021年4月29日，《Clinical Cancer Research》该网站发表文章了“相当少采用血红蛋白ctDNA探测合腺癌病人或多或少存留病变（MRD）”的社论，首次公开了Guardant Reveal的分析合果显示：MRD探测能用度远超91%，抗原将近100%，这些发掘出默许了相当少血红蛋白ctDNA-MRD探测（Tumor-uninformed assays）的潜在皆科广泛应用。

2021年8月13日，《Clinical Cancer Research》该网站发表文章了“顺应潮流：相当少血红蛋白ctDNA-MRD探测的广泛应用同一时间景”的社论，在这里深入分析们争论分析报告了相当少血红蛋白ctDNA探测MRD的控制能力，以及将底物导入到ctDNA探测的潜在必要。2

Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 争论了相当少血红蛋白ctDNA-MRD探测在合腺癌（CRC）病人当中的潜在皆科广泛应用。

▲ ctDNA底物和DNA型在两项分析当中的广泛应用比较（Parikh和Taieb）

合腺癌（CRC）的疗程几乎面对着着一个终究，即极多的CRC病人因后期疾病罹患而主因死亡者。尽管皆科转用了标准化的来进行疗程，但更高风险IIIC期CRC病人的5年生存百余人也相当少有53%，正因如此是没有发掘出医学影像上未探测到的或多或少存留病变（MRD）。4

目同一时间，仍亟必需确切考虑到哪些病人术后存在MRD，以努力他的学生减少或提更高来进行疗程，并提更高治疗者的意味著特质，同时最大限度地减少能避免疗程的无关有毒。

在依然的几年里，我们对ctDNA在CRC病症和病状当中的广泛应用有了广泛的明白。目同一时间，基于ctDNA的MRD分析报告恰巧广泛广泛应用领域帕金森氏症的疗程当中。

ctDNA是由DNA的短图片合三组（大约130-150bp），由骨髓通过突变、坏死或增生被囚到循环系统当中。 ctDNA的半衰较短致使其成为敏感的实时负担研究课题，它的存在意味著反映了医学影像上看不到的质转移。

在治疗者特质疗程合束后，ctDNA当中出现的体细胞DNA型对随后的医学影像罹患兼具较更高的阳特质计算意味，例皆是当这些DNA型与截肢的许多三组织当中的DNA型相匹配时。探测这种ctDNA定义的MRD可以在I-III期CRC当中提同一时间医学影像数月计算罹患，从而为一三组再一但会罹患的CRC病人透过一个分析报告新近疗法的站内。然而，这些ctDNA制度本土化DNA型定义的MRD探测工具的能用度几乎是有限的，亟必需改进其探测特质能。

ctDNA的底物探测优于ctDNA的制度本土化DNA型探测。ctDNA的底物出现异常在CRC当中相当常见，并被当作大多数癌变的后期阶段性。这种底物，具体定义为DNA当中胞嘧啶的C5位置添加甲基基团，通气邻近DNA的表将近，都有经典电影的抑退行特质失活。与制度本土化DNA型相对来说，CRC当中存在更加多的底物出现异常区域，为更加更高MRD探测的能用度透过了机但会。SEPT9，就是第一个透过血浆探测单DNA底物出现异常开展滴查和后期探测CRC的工具。尽管ctDNA底物有这些优点，但这些相同的特特质也必需要小心谨慎，以保持良好探测分析工具的抗原，并能避免骗阳特质的意味著特质。

在这种背景下，Parikh和Taieb的总括最新近分析合果为我们对ctDNA特质能的解读透过了可靠的补充，即必需要原发许多三组织，相当少通过血浆ctDNA底物或共同ctDNADNA型即可开展确切的MRD分析报告。与其他必需要对原发许多三组织开展高通量以他的学生后续ctDNA分析工具的探测不同，总括分析探讨了Tumor-uninformed assays的有效特质，它有几个战术上，都有快速的TAT，降低初始费用，对许多三组织过剩或不必需用的病人开展受控。

Parikh等人透过了一种ctDNA底物融合ctDNA制度本土化DNA型的通常panel开展MRD的分析工具分析报告（NGS工具），与其他商业上必需用的MRD探测工具相对来说，这种工具不必需要截肢的许多三组织以及个性化本土化。在再一疗程后采用时，这种相当少血红蛋白ctDNA-MRD探测对罹患兼具皆科意味的抗原（100%）和能用度（55.6%），通过导入表观遗传物质特质和主干受控分析工具，其能用度可进一步更加更高至91%。1 该工具被可用恰巧在开展的同一时间瞻特质分析，都有他的学生IIA期合肠癌疗程决策的NRG合作三组分析（NCT04068103）。虽然还必需要额皆的合果显示集来可验证这些发掘出，但这些合果断定了基于ctDNA的MRD探测在不可疑的情形可拒绝接受的探测特质能特质。

Taieb等人的分析透过了一对先同一时间被断定是CRC截肢后病状无关的底物DNA标记物WIF1和NPY（ddPCR工具），并将它们广泛应用领域PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验性，将III期CRC病人随机分为3个月 vs 6个月的来进行本土化学治疗。在对参加III期试验性的III期CRC病人开展的首次ctDNA-MRD分析报告当中，有13.8%的病人术后为ctDNA-MRD阳特质，并被确认为分立的病状研究课题。3 同时，深入分析也指出，与其他转用NGS工具的ctDNA-MRD分析相对来说，本分析当中ctDNA的阳特质百余人较低。能用度和PPV或多或少低于NGS探测合果，ctDNA-MRD阳特质和阴特质的5年DFS计有65%和73%，尽管来进行疗程的和不令人满意的同一时间分析工具合果显示执行意味著但会对这些合果导致影响。该工具例皆的是其相较简单，相当低的费用和潜在的带入特质，不必需要商业探测当中所见的专利权探测工具。恰巧在开展的同一时间瞻特质分析将进一步分析报告相当少血红蛋白ctDNA探测应该很难确切分析报告MRD，以便对CRC病人开展风险顶层，并他的学生来进行疗程决策。

无论转用何种工具，相当少用血红蛋白ctDNA-MRD探测来他的学生CRC病人的疗程决定，必需要可靠且确切的探测工具。必需进一步更加更高相当少血红蛋白ctDNA-MRD探测的能用度来考虑到哪些病人可以从疗程降级当中受益，以避免不恰当地选择更高危病人拒绝接受较低高强度的疗程。Parikh及其同僚的分析最近，导入遗传物质和表观遗传物质以及主干血红蛋白受控，可突出更加更高相当少血红蛋白ctDNA-MRD的能用度。恰巧因如此，ctDNA-MRD探测的更高抗原对于ctDNA作为一个清晰的生物学研究课题来考虑到疗程适配是至关最重要的。由于抗原过剩，骗阳特质的ctDNA-MRD意味著但会使病人拒绝接受能避免的强本土化学治疗程。Parikh及其同僚的分析合果断定，除制度本土化DNA型皆，还可以通过融合表观遗传物质底物特质的分析工具来保持良好抗原。Taieb等人的分析工具工具的战术上在于更加更高了皆科特质的能用度和病状，但是，恰巧如深入分析拒绝接受的那样，单独的两个DNA底物标记意味著无法透过与融合制度本土化DNA型工具的特质能特质。最重要的是，这项临时工也强调了标准化本土化分析工具同一时间条件的最重要特质，因为各种分离出工具可以在相当大程度上影响ctDNA的得百余人和清晰特质。在未来的分析当中，这些分析工具同一时间的考虑将更加越来越最重要。

底物被划入MRD探测的前瞻性是明确的，努力这些方面将再次更加更高这一代MRD探测的特质能。总之，相当少血红蛋白ctDNA-MRD的探测透过了一个奇特的机但会，采用一种无创工具来探索疗程方案，并有意味著根除更高危病人的质转移特质病变。这些分析合果无疑为未来ctDNA-MRD他的学生的同一时间瞻特质皆科试验性先驱者了道路。

MRD，几乎是一个快速工业发展的领域，我们预料近两年意味著但会出现在此之后证词，要么推测出MRD探测的皆科效用的普遍特质，要么推测出MRD探测的其他战术上和新近用途。

参考资料：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.